長期間にわたって使わないときは、干して十分に湿気を逃がしてから、通気性のあるふとん袋やのり糊の付いていない清潔なシーツなどに包み、防虫剤を入れて湿気の少ない所にしまってください。押入れに収納するときは、スノコなどを敷いておくと湿気が防げます。収納中もときどき陰干しをして湿気を逃がしてください。
真綿ふとんは吸湿性・放湿性に優れているため、肌を心地よく保ち、ムレを防ぎます。 また、軽くてやわらかく自然に身体にフィットし、保温性にも優れています。また、静電気が起こりにくいので、ホコリやチリを寄せつけず、消臭効果もあるので清潔で衛生的です。なお、真綿はアミノ酸を含んでいますので、皮膚細胞を活性化させ健康的な素肌を保つことができると言われています。